广州医科大学附属第三医院新生儿科是广州医科大学儿科学硕士研究生培养基地，是国家新生儿围产期医学专科医师培训基地、全国新生儿科医师联盟常务理事单位、广东省重症新生儿救治中心、广东省新生儿保健特色专科、广东省新生儿专科护士培训基地、广东省青年文明号等；同时，也是中国医师协会新生儿科医师分会委员单位，以及广东省医学会新生儿学分会、广东省医师协会新生儿科医师分会、广东省医院协会新生儿科管理专业委员会等副主任委员单位。

医院新生儿专业于“十二五”期间已评为省级临床重点专科，本次再度入选省级临床重点专科，是卫健部门对新生儿专业医疗服务质量和专科能力的再次肯定。

新生儿科在荔湾院区、黄埔院区均分别开设病区，总编制床位188张，目前实际开放138张。

亚专科建设以超早产儿综合管理作为优势特色专科，主要亚专科包括：超早产儿、新生儿呼吸、新生儿围术期管理、出生缺陷与遗传代谢病、新生儿消化与营养、新生儿血液与循环、新生儿神经、高危儿随访、新生儿重症护理等。

病房和门诊设置包括：新生儿重症监护单元、超早产儿监护单元、围术期监护单元、普通新生儿病区、家庭参与式护理病房、日间病房、新生儿科门诊、高危儿随访门诊等。目前出院人次约3500人/年，高危儿随访约1.5万人次/年。

新生儿科在危重新生儿救治、早产儿综合管理等领域技术实力雄厚。目前拥有包括体外膜肺治疗仪（ECMO）、持续血液滤过治疗仪（CRRT）、院外转运系统、常频高频一体化呼吸机、无创呼吸机、高档暖箱、脑功能监护仪、无创心排监测仪、经皮二氧化碳监测仪、近红外光谱氧饱和度监测仪、多功能中央监护系统、亚低温治疗仪、一氧化氮吸入治疗仪、床旁超声、床旁血气分析仪、母乳分析仪、支纤镜系统等先进设备，并能熟练开展相关技术项目。

近5年来，年收治超早产儿（胎龄＜28周）/超低出生体重儿（出生体重＜1000克）80-100例/年，整体存活率超过90%，达国内先进水平。曾成功救治出生体重385克的超早产儿，为省内救治成功的最低出生体重儿。